Köszi szépen, hogy kipróbáltad! Már ez is nagy segítség, mert ezek szerint szűz Drupal esetén jól működik, ergo nem bugról van szó, hanem nálam van a para: vagy smink (pl. egy theme_* v. template_* override, vagy más) vagy modul okozza. Teljesen szűz Drupalon is ki fogom próbálni.

Frissítés óta tapasztalom ezt a jelenséget, de Drush-sal a core-t és contrib modulokat egyszerre frissítettem (pl. Entity API, i18n, stb.), de most legalább kiderült, hogy nem a core, hanem vmi kiegészítő modul a hibás.

Még két kérdés:

1. Ezek szerint nálad a megjelenítés során, a default 0/1 értékekkel kiírja rendesen a kiválasztott 0/1 értéket?
2. A '#markup' kulcs az egyes elemekre egyszerűen a drupal_render()-ben állítódik össze, amit aztán megkap a theme_field() függvény, és pl. $variables['items'][0]['#markup'] módon érhető el? Az tiszta, hogy egy foreach-csel megy végig a $variables['items']-en kiíratáskor, majd megint átereszti a drupal_render() függvényen, de hátha van előtte valami formázó - igaz, pont azt írtad, hogy "tényleg nincs ellátva különösebben display formatterekkel ez a mező", de hátha van még egy hely, ahol véletlenül módosításra kerül az adat; megpróbálnám valahogy debuggolni, honnan eredhet a gáz.

   A list.module fájl list_field_info()-jában amúgy látszik a 'list_boolean' típus, az options.module-ban pedig az options_field_widget_info()-ban az 'options_onoff' widget, de innen sokkal tovább nem tudtam jutni, hogy akkor most mégis honnan kezdjem a debuggolást, hol veszhet el a #title vagy épp az érték.

Esetleg érdemes lenne boolean helyett egy mezei list fieldet odarakni.

Ez most nem bejövős megoldás, mert pont ez a ki/bekapcsolós rész kellene az űrlapra, így nagyon kényelmes lenne. De amúgy az ötlet nem rossz, meg lehetne kerülni ezzel a dolgot, de inkább ezt akarnám megoldani.

Addig is eléggé gányolósan, kényszerből manuálisan módosítottam a formban való megjelenését: egy hook_form_FORM_ID_alter()-ben (nyilván a FORM_ID-t cserélve a form azonosítójára) felülírtam a
$form['field_EZ_AZ_ÉN_MEZŐM']['und']['#title']
értékét, ami mérhetetlenül gáz, mivel így nyelvfüggő a megoldásom ('und'), meg amúgy is undorító módja a módosításnak, de most gyorsan kellett a dolog. Ha jut eszedbe kevésbé undorító kényszermegoldás, jelezd plíz. :D
Ja, a node/term megjelenítésekor látható érték (a default esetben 0/1), ami szintén nem jelent meg, kevésbé volt fontos, de azt is kényszermegoldással összetákoltam (sic!):
egy theme_field()-ben a foreach részt módosítottam (lásd az $element['#field_type'] === 'list_boolean' részt):

  // Render the items.
  $output .= '<div class="field-items"' . $variables['content_attributes'] . '>';
  foreach ($variables['items'] as $delta => $item) {
    // páros/páratlan jelölések
    $classes = 'field-item ' . ($delta % 2 ? 'odd' : 'even');
 
    // ITT VAN A TÁKOLÓS, MÓDOSÍTOTT RÉSZ
    // TODO: checkboxnál a renderelés során az érték nem kerül kiíratásra, debuggolni kéne, a #markup részbe már NULL kerül
    // addig is ocsmány kényszermegoldás:
    if($element['#field_type'] === 'list_boolean'){
      if(empty($item['#markup'])){
        $item['#markup'] = (string)$element['#items'][$delta]['value']; // ebben defaultból 0 v. 1 van
      }
    }
 
    $output .= '<div class="' . $classes . '"' . $variables['item_attributes'][$delta] . '>' . drupal_render($item) . '</div>';
  }
  $output .= '</div>';